скачать книгу бесплатно
Общая вирусология с основами таксономии вирусов позвоночных
Коллектив авторов
Учебник представляет собой систематизированное изложение общей вирусологии, методов диагностики вирусных инфекций и таксономии вирусов позвоночных, что соответствует пунктам профессиональной компетентности ПК-1 (демонстрирует базовые представления о разнообразии биологических объектов, понимание значения биоразнообразия для устойчивости биосферы) и ПК-2 (использует методы наблюдения, описания, идентификации, классификации, культивирования биологических объектов) федерального образовательного стандарта высшего профессионального образования по направлению подготовки 020400 – Биология (степень – «Бакалавр», «Магистр»). В учебнике представлены общие сведения о истории вирусологии, химическом составе генетике репродукции вирусов, выделении и очистки вирусных препаратов, методах диагностики вирусных инфекций, таксономии вирусов позвоночных.
Общая вирусология с основами таксономии вирусов позвоночных
Введение
Вирусология – наука о морфологии, физиологии, генетике, экологии и эволюции вирусов. Медицинская и ветеринарная вирусология исследует вирусы-паразиты человека и животных, их роль в этиологии и патогенезе инфекционных и опухолевых болезней, разрабатывает специальные методы диагностики, способы этиотропной терапии и специфической профилактики.
Вирусы являются одной из наиболее распространенных групп живых организмов, которые способны заражать не только практически всех представителей флоры и фауны, но и микроорганизмы. Эффективность борьбы со многими вирусами не имеет положительных результатов, так как вирусы не только имеют природный резервуар в окружающей среде, но и постоянно изменяются (мутируют), в связи с чем снижается эффективность проведения вакцинопрофилактики. Одним из наиболее ярких примеров является неэффективная многолетняя борьба с вирусом иммунодефицита человека.
Своевременность и точность постановки диагноза вирусного инфекционного заболевания позволяет не только осуществить эффективное лечение, направленное на уничтожение вирусного агента, но и провести профилактику дальнейшего распространения данного заболевания с учетом индивидуальных особенностей вириона. Например, в XX веке повсеместно было ликвидировано такое заболевание как оспа по средствам проведения массовой вакцинации населения.
В данном учебном пособии подробно рассмотрены вопросы основ классификации (таксономии) вирусов позвоночных, международный код классификации и номенклатуры вирусов, характеристики семейств и родов ДНК и РНК-содержащих вирусов, диагностики вирусных заболеваний и методы выделения и очистки вирусных препаратов.
Обозначения и сокращения
AGE – агарозный гель
ANU – Australian National University
ATCC – American Type Culture Collection
bр – (base pair) пара оснований
ds – (double-stranded) двуспиральный
dsDNA – двуспиральная ДНК
dsDNA-RT – двуспиральная ДНК, в репликативном цикле которой имеется этап обратной транскрипции с РНК
dsRNA – двуспиральная РНК
dsRNA – двуспиральная РНК
G (GP) – поверхностный гликопротеин
IN – интеграза
IRES – (internal ribosomal entry site) внутренний сайт входа рибосомы
kb – (kilo base) килобаза (тысяча оснований)
kbp – (kilo base pare) тысяча пар оснований
kDa – (kilo Dalton) килодальтон
MA – (matrix) матрикс
Mr – (relative molar mass) относительная молярная масса
N – (nucleoprotein) нуклеопротеин
NC – (nucleocapsid) нуклеокапсид
NC – (nucleocapsid) нуклеокапсид)
NNS – негативный несегментированный геном РНК
NP – нуклеопротеин
NS – неструктурные белки – это предшественники структурных белков, регуляторные белки и ферменты, обслуживающие процесс внутриклеточной репродукции вируса и не входящие в состав вирусной частицы
NSF – National Science Foundation
NssRNA – односпиральная РНК негативной полярности
nt – (nucleotide) нуклеотид
ORF – (open reading frame) открытая рамка считывания
PAGE – полиакриламидный гель
PR – протеаза
РrР – приемный протеин
RT – (reverse transcriptase) обратная транскриптаза
RT – обратная транскриптаза
sgRNA – (subgenomic RNA) субгеномная РНК
SH – интегративный мембранный протеин
SP – сериновая протеаза
ss – (single-stranded) одноцепочечный
ssDNA – односпиральная ДНК
ssRNA – односпиральная РНК
ssRNA-RT – односпиральная РНК в репликативном цикле которой имеется этап обратной транскрипции
SU – (surface) поверхностный
T – (triangular number) триангулярное число
VPg – (genome-linked protein) геном-ассоциированный протеин
VP – структурные белки, входящие в состав вирусной частицы
БСА – альбумин нормальной сыворотки быка
ДНК – дезоксирибонуклеиновая кислота
ИБ – метод иммуноблотинга
ИД
– 50 % инфекционная доза для животных или для куриных эмбрионов
иРНК – информационная рибонуклеиновая кислота
ИФА – иммунофлюоресцентный анализ
ИЭМ – иммунная электронная микроскопия
ИЭТ – изоэлектрическая точка
кДНК – клеточная дезоксирибонуклеиновая кислота
КПЧ – клетки почек человека
ЛД
– 50 % смертельная доза
М – матриксный протеин
ММГ – методы молекулярной гибридизации
мРНК – матричная рибонуклеиновая кислота
МФА – метод иммунофлюоресценции
ПЦР – полимеразная цепная реакция
ПЭГ – полиэтиленгликоль
РБО – реакция бляшкообразования
РВИЭФ – реакция встречного иммуноэлектрофореза
РГА – реакция гемагглютинации
РГАд – реакции гемадсорбции
РЗБО – реакция задержки (нейтрализации) бляшкообразования
РЗЦПД – реакция задержки цитопатического действия вирусов
РИФ – реакция иммунофлюоресценции
РН – реакция нейтрализации
РНК – рибонуклеиновая кислота
РРГ – реакция радиального гемолиза
рРНК – рибосомальная рибонуклеиновая кислота
РСК – реакция связывания комплемента
РСР – папаино-подобная цистеиновая протеаза
РТГА – реакция торможения гемагглютинации
РТГАд – реакция торможения гемадсорбции
СА – (capsid protein) капсидный протеин
СР – (capsid protein) капсидный протеин
СРЕ – (cytopathic effect) ЦПЭ, цитопатический эффект
ТКИД
– 50 % инфекционная доза для тканевой культуры
ТМ – (transmembrane) трансмембранный
тРНК – транспортная рибонуклеиновая кислота
УФ – ультрафиолет
ФИТЦ – флюоресцеина изотиоцианат
ФЭЧ – фибробласты эмбриона человека
ЦПД – цитопатическому действию
ЭМВ – электронно-микроскопическое выявление
1 История вирусологии, природа и происхождение вирусов
1.1 Открытие вирусов
