Анатолий Клёсов.

ДНК-генеалогия от А до Т



скачать книгу бесплатно

(A00 – Perry)


Это – так называемый 111-маркерный гаплотип, самый «продвинутый» в отношении числа определяемых маркеров. Чтобы показать, что в нем необычного, приведу для сравнения свой гаплотип:


13 24 16 11 11 15 12 12 10 13 11 30–16 9 10 11 11 24

14 20 34 15 15 16 16–11 11 19 23 15 16 17 21 36 41

12 11–11 9 17 17 8 11 10 8 10 10 12 22 22 15 10 12 12

13 8 15 23 21 12 13 11 13 11 11 12 13–31 15 9 15 12 25

27 19 12 12 12 12 10 9 12 11 10 11 12 30 12 14 25 13 9

10 18 15 20 12 24 15 12 15 24 12 23 19 11 15 17 9 11 11

(R1a – мой гаплотип)


Между ними – 181 мутация (!). Для сравнения, между A00 и R1b-L21, одним из самых распространенных гаплотипов в Западной Европе – 175 мутаций, то есть близкое число.


13 24 14 11 11 14 12 12 12 13 13 29–17 9 10 11 11 25

15 19 29 15 15 17 17–11 11 19 23 16 15 18 17 36 38 12

12 – 11 9 15 16 8 10 10 8 10 10 12 23 23 16 10 12 12

15 8 12 22 20 13 12 11 13 11 11 12 12–35 15 9 16 12

25 26 19 12 11 13 12 11 9 12 12 10 11 11 30 12 13 24 13

10 10 21 15 19 13 24 17 12 15 24 12 23 18 10 14 17 9

12 11 (R1b-L21)


Хорошо, сравним с гаплотипом гаплогруппы A1b-M13, то есть той же серии гаплогрупп А, в данном случае из Саудовской Аравии:


13 21 15 9 12 12 12 11 12 13 11 31–18 8 10 9 11 23

16 19 35 11 11 14 15–11 11 21 21 15 14 17 15 30 35 12

10 – 10 9 12 12 7 12 12 8 10 9 0 24 24 17 13 11 16 15

9 11 25 23 17 14 9 14 9 11 11 11–33 15 8 14 10 21 28

20 13 12 13 10 12 10 10 11 9 10 13 31 12 12 27 15 9

12 19 15 20 15 24 16 12 15 27 13 19 18 9 15 19 9 13 11

(A1b-M13)


Между A00 и A1b – 177 мутаций. Иначе говоря, по структуре своего гаплотипа A00 равноудален и от R1a (Восточная Европа), и от R1b (Западная Европа), и от A1b (Ближний Восток). И неудивительно – расчеты с использованием самых «медленных» маркеров показали, что гаплогруппа A00 образовалась примерно 220 тысяч лет назад.


Покажем, что по сути означают снипы в Y-хромосоме на примере гаплогруппы A00. Здесь даны несколько примеров снипов A00 – их индекс, присваемый каждому снипу, какой нуклеотид мутировал в какой, и порядковый номер данного нуклеотида в Y-хромосоме из примерно 58 миллионов нуклеотидов. За предковые (исходные) нуклеотиды принимали те, которые идентифицировали в Y-хромосомах мужчин планеты как неизменные (предковые), и подтвержденные по Y-хромосоме шимпанзе. Ни один из приведенных ниже снипов не найден в Y-хромосомах представителей других гаплогрупп. Этот факт показывает, что ДНК-генеалогическая линия гаплогруппы А00 является отдельной, независимой ветвью эволюционного (Y-хромосомы) дерева человечества.



В связи с этим возникает вопрос – а когда жил общий предок Homo sapiens, общий предок современных людей? Тот, который на самом верху диаграммы обозначен как Y Root? Можно ли это время рассчитать? Ответ – можно, но с определенной степенью допущений. Первое и самое главное допущение – что общий предок сегодняшних людей на Земле на самом деле существовал. Естественно, речь не идет о том, что на Земле когда-то жил один мужчина, и с ним рядом была одна женщина, как повествует библейская притча. Такого никогда не было. Во все времена было множество мужчин и множество женщин, а до них было множество самцов и самок, предшественников тех самых мужчин и женщин, и переход одних в других занял миллионы лет, и никто не может дать четких определений, в чем выражался этот переход, это все вопросы определений, которых, в общем-то, нет. Да, наверное, никого это отсутствие четких определений особенно и не беспокоит.

Чисто концептуально, «общий предок» всех людей на сегодняшней планете – это тот, потомство которого выжило, в отличие от множества его современников, и продолжилось в потомках до настоящего времени. Помимо этого – это был тот человек, у которого было как минимум два сына, потомство которых выжило до настоящего времени. Как следствие первых двух условий, все потомки унаследовали снип-мутации своего «первопредка», и добавили снип-мутации в последующем. Поэтому есть еще одно условие, точнее, следствие – мутации в гаплотипах потомков при экстраполяции в прошлое сходятся к «первопредку». Таким образом, можно определить его гаплотип, независимо от того, как давно он жил.

В итоге вопрос про «общего предка человечества» несколько расплывается. В каждой прямой ДНК-линии её общий предок жил относительно недавно – где сотни лет назад, где тысячу-другую лет назад. Но совокупность ДНК-линий, даже только выживших, помещает общих предков на 20–60 тысяч лет назад в каждой гаплогруппе. Совокупность

ДНК-линий разных гаплогрупп помещает общего предка неафриканцев на 64 ± 6 тысяч лет назад (как будет дополнительно показано ниже), до наиболее отдаленного бутылочного горлышка популяции, а африканцев – примерно на 220 тысяч лет назад[8]8
  Клёсов, А.А., Килин, В.В. (2015) Калькулятор Килина-Клёсова для расчета времен до общих предков (TMRCA): новое издание. Вестник Академии ДНК-генеалогии, т. 8, № 3, стр. 321–375.


[Закрыть]
, но это не потому, что африканские предки древнее, а потому что по какой-то причине совокупность африканских (по их нынешнему месту обитания) ДНК-линий прошла бутылочное горлышко популяции намного ранее.

Можно ли считать, что 220–240 тысяч лет назад жил общий предок современного человечества? Нет, нельзя. Потому что неафриканские и африканские ДНК-линии сходятся к общему предку примерно 160 тысяч лет назад (см. выше). Именно тогда разошлись африканские и неафриканские (по нынешнему месту обитания) ДНК-линии. Но глубже во времени уходит общий эволюционный ствол африканцев и неафриканцев, который расходится на гаплогруппы A00 и A0-Т примерно 220 тысяч лет назад. У нас нет оснований не считать носителей гаплогрупп A00 и A0-Т не членами вида Homo sapiens, так что общий предок современного человечества уходит глубже 220–240 тысяч лет назад. Но еще глубже, 300-400-500 тысяч лет назад, уже времена образования неандертальцев, которых вряд ли можно считать общими предками современного человечества. Вот и очерчены рамки времен возникновения общего предка современного человечества. Называть его «Адам», чем увлекаются некоторые, нет никаких оснований.

Возвращаемся к Адванули. Никто не знает, где именно образовалась гаплогруппа A00. Сейчас ее носители, Адванули, помимо тех, кто несколько веков назад попал в Америку, видимо, чернокожими рабами, живут в Камеруне, входят небольшой частью в племя Мбо, и говорят на языке мбо, который входит в языковую группу банту. В этом племени тест на гаплогруппы взяли у 174 человек, и у и из них (то есть у 6.3 %) оказалась гаплогруппа A00. Поскольку все племя Мбо по численности оценивается в 67 тысяч человек, то, если пропорция сохранится, всего насчитают примерно 4 тысячи Адванули, и это после двухсот с лишним тысяч лет существования гаплогруппы A00. Правда, недавно тест расширили, и проверили гаплогруппы у соседнего племени Бангва, и у них оказалось 35 носителей A00 из двухсот, то есть уже 17.5 %. У остальных были гаплогруппы E1b1a, B2a1, A0 и другие, к тому же в Камеруне широко представлена гаплогруппа R1b.

Надо подчеркнуть, что приведенная датировка вовсе не означает, что общий предок современных Адванули жил несколько больше 200 тысяч лет назад, и все они ведут прямую родословную от него. Датировки ведь рассчитывали или по расхождению их гаплотипов, то есть по числу мутаций, от других популяций на планете, или по времени появления снип-мутации в Y-хромосоме Адванули. Для того, чтобы узнать, когда жил фактический общий предок выборки Адванули, были определены гаплотипы тех и человек, которых выявили при ДНК-тестировании. Правда, авторы статьи[9]9
  Mendez, F.L., Krahn, Т., Schrack, В., Krahn, А.-М., Veeramah, K.R., Woerner, A.E., Fomine, F.L.M., Bradman, N., Thomas, M.G., Karafet, T.M., Hammer, M.F. (2013) An African American paternal lineage adds an extremely ancient root to the human у chromosome phylogenetic tree. Am. J. Hum. Genet. 92,454–459.


[Закрыть]
, в которой это описано, не смогли посчитать, когда жил общий предок этой группы Адванули, но разумно предположили, что жил он относительно недавно, поскольку гаплотипы тех 11 человек были почти одинаковыми. А посчитать не могли, потому что выбросили из тестирования ряд маркеров, с которыми не умели работать, вместо 111-маркерных гаплотипов в итоге получили 95-маркерные, но не знали величину константу скорости мутации.

Сделаем эту работу за авторов статьи. Константа скорости мутаций для 95-маркерных гаплотипов равна 0.161 мутаций на гаплотип за 25 лет, что называется в ДНК-генеалогии условным поколением. Все 11 гаплотипов содержали всего 29 мутаций, что дает 29/11/0.161 = 16 условных поколений, но с учетом того, что 45 аллелей (из 1045 аллелей) авторы определить тоже не смогли, то до общего предка на самом деле 17 условных поколений, то есть 425 ± 90 лет.

Итак, сама гаплогруппа A00 образовалась более 200 тысяч лет назад, причем неизвестно где, а общий предок носителей A00 из Камеруна жил примерно 425 лет назад. Если добавить к серии из Камеруна еще гаплотип афроамериканца той же гаплогруппы (по фамилии Перри), который отличается от предкового гаплотипа камерунцев на и мутаций, то их общий предок, камерунцев и афроамериканца, жил примерно 1125 лет назад.

Такая картина весьма характерна для популяций Африки. Гаплогруппа образовалась десятки, а то и сотни тысяч лет назад, хотя мы и не знаем, где – в Африке или за ее пределами, и если второе – то не знаем, когда предки мигрировали в Африку. В Африке вообще обитают носители почти всех гаплогрупп мира, в большинстве своем прибывшие в Африку в ходе последних нескольких тысяч лет назад. Самая распространенная гаплогруппа в Африке – E1b, тоже прибыла «со стороны», как и гаплогруппа R1b, которая сейчас в значительных количествах обитает в Камеруне и окружающих странах. Время от времени по разным причинам, в основном климатическим, а также голода, эпидемий, вражды с соседними племенами, популяция резко сокращается, и либо полностью вымирает, либо проходит «бутылочное горлышко популяции», оставаясь в минимальном количестве, и если повезет, то размер популяции через века более или менее востанавливается. Это напоминает цепь сосисок с перетяжками. Так и Адванули – история рода насчитывает 200 тысяч лет, а выживших наших современников – всего несколько тысяч человек. Мы не знаем, в какой степени выборка с общим предком, жившим примерно 425 лет назад, отражает последний период истории всех несколько тысяч Адванули, но, скорее всего, в целом отражает.

Порой перетяжки образуют такие сужения, что при расчетах они формально соответствуют одному человеку, патриарху после прохождения бутылочного горлышка. Таким образом, имеем последовательную цепь патриархов. Это легко представить на примере хрестоматийного «последнего из могикан» Фенимора Купера. Вспомним сюжет – от всего племени могикан остался один мужчина. Умрет он – и вся линия ДНК, идущая из глубин, возможно, 12–15 тысяч лет назад, оборвется. Для следующего поколения американских индейцев могикан как бы и не существовало, несмотря на их многотысячелетнюю историю. Но если «последний из могикан» выживет, женится, обзаведется сыновьями – он станет патриархом для последующих поколений его рода.

Подобных случаев в истории Земли было, видимо, неисчислимое количество.

Недавно картина с гаплогруппой A00 была дополнена, к ней добавлены исследования в племени Бангва, которые показали наличие носителей гаплогруппы A00 и там.


Получение образца ДНК в юго-западном Камеруне (предоставлено В. Schrack). Хотя фото представлено в связи с тестированиями гаплогруппы A00 в Камеруне, неизвестно, какую гаплогруппу выявит данный конкретныйтест.


Но в этой ситуации очевиден вопрос – а как эти Адванули выглядят? Может, они пигмеи, или вообще явно отличаются по виду от остальных людей, как мы их знаем? Информацию об этом найти трудно, и вот, пожалуй, только то, что найти удалось[10]10
  http://www.lebialem.info/


[Закрыть]
,[11]11
  Однонули – это носители гаплогруппы A0, африканской по нынешнему месту жительства. Где эта гаплогруппа образовалась – пока неизвестно. Датировка по гаплотипам дает ее «возраст» 180 тысяч лет, датировка по снипам не дана, видимо, потому, что данных пока мало. Мы приводим это здесь только для того, чтобы показать, насколько передним краем науки это сейчас является, и как много здесь пока неясностей. Но датировка по гаплотипам 180 тысяч лет для времени образования гаплогруппы A0 более надежна, во всяком случае пока.
  В любом случае, гаплогруппы A00 и A0 пока являются древнейшими, и образовались до расхождения эволюционного (Y-хромосома) дерева человечества на африканскую и неафриканскую ветви. Нам этого для концептуальных рассмотрений ДНК-генеалогии человечества пока достаточно.
  Однонулей, то есть носителей гаплогруппы A0, найдено в мире всего полтора десятка человек. Они рассеяны парами и тройками по субкладам A0,


[Закрыть]
. Последнее – видео, в котором, как сообщают те, кто видео предоставили, показаны люди племени Бангва. На вид они совсем не отличаются от многих других африканцев. Более того, во всяком случае, некоторые говорят по английски, пользуются айфонами и айпадами. Хотя, впрочем, последние могут быть визитеры, прибывшие с кинооператорской командой.

Глава 2
А0-Т, древнейшая гаплогруппа в Y-хромосоме современных людей, 220 тысяч лет назад

«Современных людей» в названии этого раздела означает – всех мужчин планеты, кроме адванулей, носителей гаплогруппы А00. Диаграмма, приведенная ранее, показывает, что гаплогруппы А00 и А0-Т являются «параллельными», они разошлись от эволюционного ствола Y-хромосомы человечества. Разница между ними, в частности, в том, что снипов гаплогруппы А00 в ДНК читателей этой книги нет, если только ее не читают члены племени Мбо из Камеруна, но вероятность этого весьма мала. Еще разница – в количестве снипов, имеющихся в Y-хромосомах изученных людей, имеющих гаплогруппы А00 и А0-Т. Это можно перефразировать, как количество снипов, выстраивающихся в цепочку от снипа, характерного для гаплогруппы А00 или А0-Т, до настоящего времени, поскольку изучались ДНК наших современников. Носители гаплогруппы A00 есть в наличии, это потомки Альберта Перри в США, и члены племени Мбо в Камеруне. Носителей гаплогруппы A0-T как таковой пока не нашли, но ее снипы есть в Y-хромосомах подавляющего количества мужчин на Земле, а именно имеющих гаплогруппы от В до Т.

Глава 3
Однонули, 180 тысяч лет назад до настоящего времени

Однонули – это носители гаплогруппы А0, африканской по нынешнему месту жительства. Где эта гаплогруппа образовалась – пока неизвестно. Датировка по гаплотипам дает ее «возраст» 180 тысяч лет, датировка по снипам не дана, видимо, потому, что данных пока мало. Мы приводим это здесь только для того, чтобы показать, насколько передним краем науки это сейчас является, и как много здесь пока неясностей. Но датировка по гаплотипам 180 тысяч лет для времени образования гаплогруппы А0 более надежна, во всяком случае пока.

В любом случае, гаплогруппы А00 и А0 пока являются древнейшими, и образовались до расхождения эволюционного (Y-хромосома) дерева человечества на африканскую и неафриканскую ветви. Нам этого для концептуальных рассмотрений ДНК-генеалогии человечества пока достаточно.

Однонулей, то есть носителей гаплогруппы А0, найдено в мире всего полтора десятка человек. Они рассеяны парами и тройками по субкладам А0, у всех происхождение, по их свидетельствам, неизвестно, что характерно для афроамериканцев. Несколько поколений в рабстве полностью утратили их память о родине – где она была и когда. К тому же рабам в США было запрещено заводить семьи, так что семейных преданий не было как таковых. Только один носитель субклада A0b сообщил, что его предки с острова Барбадос, но они тоже были вывезены туда из Африки. Все упомянутые пары и тройки однонулей в каждом субкладе имеют одинаковые или почти одинаковые гаплотипы, что означает, что они близкие родственники друг другу. Правда, данных мало и потому, что африканский континент изучался крайне незначительно на ДНК его обитателей, хотя картина в целом уже достаточно ясна и в целом воспроизводится при очередных сериях исследований. Картина такова, что подавляющее число африканцев – потомки не-африканцев, тех, кто прибыли в Африку несколько тысяч лет назад или уже в нашей эре.

Как правило, основные гаплогруппы, названные по буквам латинского алфавита, каждая охватывает десятки и сотни миллионов людей. Это – основные неафриканские гаплогруппы, неафриканские по их преобладающему месту жительства и по месту их образования. Но для однонулей и адванулей сделали исключение, и на их численность не ориентировались. Других вариантов не было – их действительно было не с кем объединить в одну гаплогруппу. Мало их потому, что либо они затерялись среди миллиарда человек африканского населения, то есть примерно 500 млн. мужчин, которые мало охвачены тестированием ДНК, либо, что намного более вероятно, уже около 200 тысяч лет находятся на грани исчезновения. Вспомним модель «цепи сосисок с перетяжками», описанную выше.

Глава 4
О «генетическом разнообразии в Африке», что это такое, и откуда оно взялось

Итак, подавляющее число африканцев – потомки неафриканцев, тех, кто прибыли в Африку несколько тысяч лет назад или уже в нашей эре. Больше всего в Африке гаплогруппы Е, опять исходно неафриканского происхождения. Немало там носителей гаплогруппы R1b, особенно в Камеруне и Чаде, это – потомки миграций из Азии несколько тысяч лет назад, причем шлейф этих миграций, образованный современными африканскими носителями гаплогруппы R1b, ясно прослеживается со стороны Средиземноморья и уходит сторону Камеруна. Само собой, много современных носителей гаплогруппы R1b живут в Южной Африке, в основном потомки буров, но не только. В итоге этих многотысячелетних миграций в Африку, плюс относительно небольшая доля «исконных» африканских гаплогрупп, если такие вообще есть, к тому же понятие «исконный» нуждается в определении, в Африке наблюдается огромное «генетическое разнообразие». Оно, конечно, имеет мало отношения к происхождению человечества, и никак не связано с тем, что Африка – «прародина человечества». Оно связано с «прародиной» настолько, насколько «генетическое разнообразие» жителей Нью-Йорка связано с тем, что Нью-Йорк – прародина человечества. Разнообразие в подобных случаях на самом деле связано с интенсивностью миграций в рассматриваемый регион, Африка это, Нью Йорк или Москва. «Разнообразие» вообще может рассматриваться в научной точки зрения только в замкнутых, изолированных системах. А проходной двор всегда будет отличаться «разнообразием». Поразительно, но популяционные генетики уже тридцать лет продолжают утверждать, что «разнообразие» в Африке доказывает, что Африка является «прародиной современного человечества», и якобы подтверждает «теорию выхода анатомически человечества из Африки».

В академической литературе за последние четверть века регулярно появляются утверждения о том, что африканские ДНК-линии «самые древние», хотя основания для того не приводятся. И понятно, почему не приводятся – их просто нет. Давайте для начала разберемся, что такое «древние ДНК-линии», понимая под этим длинные цепочки снипов Y-хромосомы.

Но разбираться особенно и не надо, потому что у всех мужчин на Земле, африканцев и неафриканцев, во всяком случае, у всех, кто делал тест на ДНК, снип-цепочки Y-хромосомы по древности одинаковы. У всех, африканцев и неафриканцев, эти цепочки снипов тянутся от общих предков с шимпанзе, орангутаном, гориллой, макакой и другими древними общими с нами предками. Так что у всех нас

ДНК-корни древние, уходящие на миллионы лет назад, и африканцы в этом отношении никак не выделяются.

Может, под «древними африканскими ДНК-линиями» популяционные генетики подразумевают древние времена жизни их общих предков, и полагают, что они намного более древние, чем у неафриканцев? Придется их огорчить, ситуация противоположная, и была описана выше, на примере адванули, общий предок их группы наших современников жил всего 425 лет назад. Африканские предки сегодняшних носителей гаплогрупп А (популяций, субкладов) почти все совсем недавние, часто всего несколько сотен лет. Иногда – между 1000 и 2000 лет. Самые древние – примерно 5000–7000 лет. Более того, откуда их цепочки снипов ведут, где жили далекие предки их гаплогрупп – никто не знает. Может, они из Африки, может, с Кавказа, может, из Сибири, может, из Европы, может, из Азии – неизвестно. Почему-то считается, что именно из Африки. Но это опять «по понятиям», правда, откуда появившимся, непонятно, извините за игру слов. Древнейшие, ископаемые ДНК находили в Европе, на Русской равнине, в Сибири, а в Африке ни разу не находили, правда, и исследований таких не было. Так откуда эти «понятия» появились? А так, стиль популяционных генетиков. В целом же, 50 гаплотипов в 37-маркерном формате четырех серий гаплогруппы А0а-М31 имеют общего предка 9270 ± 970 лет назад. Но надо обратить внимание, что это четыре серии гаплотипов, разбросанные по разным континентам, включая светлокожих европейцев, которые и понятия не имели, что у них гаплогруппа А (в вариантах). Это – не одна «ДНК-линия», это – четыре разных ДНК-линии, с четырьмя общими предками, каждый «глубиной» от 700 до 1900 лет.

Ну и где, позволительно спросить, «древнейшие ДНК-линии в Африке»? Это – миф, ничем не обоснованный. Ископаемых ДНК нет, древних линий, как мы видим, нет, к тому же, в Африке вовсе не гаплотипы группы А явяются доминирующими. Доминирует гаплогруппа E1b; в Камеруне и Чаде, и отчасти в Нигерии, доминирует гаплогруппа R1b, поэтому неудивительно, что в Африке наблюдается «высокое генетическое разнообразие», о чем мы уже говорили, только это не от древности, а от обилия носителей разных гаплогрупп, прибывших в Африку в разные времена.

Так откуда же появился этот миф о «древности африканских линий»? Датировок ведь их до последнего времени не было, да и датировки бывают, как мы убедились, нескольких видов – цепочек мутаций, уходящих далеко вглубь, до приматов; цепочек мутаций, ведущих ко временам образования соответствующих гаплогрупп; и датировок общих предков современных носителей соответствующих гаплогрупп и субкладов. Ни одна из этих датировок не «укоренена» территориально, то есть мы не знаем, на какой территории, на каком континенте образовалась та или иная гаплогруппа. Мы можем только набирать сведения и складывать фрагменты общей картины, но Африка в этом отношении находится на одном из последних мест по накопленным знаниям.



скачать книгу бесплатно

страницы: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

сообщить о нарушении